最新发布的2004年度中国科技论文统计结果显示，化学所在SCI（科学引文索引）、EI（工程索引）、ISTP（科学技术会议录索引）等检索中继续名列前茅。其中SCI收录论文508篇，继续位居全国研究机构第1名；SCI被引用论文789篇2192次，首次跃居全国研究机构第1名；EI收录论文254篇，位居全国研究机构第2名； 2004年度国内和国际论文总数902篇（CSTPCD、SCI 、EI 、 ISTP等），位居全国研究机构第2名；1995-2004年SCI收录论文累计被引用篇数2341篇，引用次数13979次，位居全国研究机构第2名。

化学所论文发表及被引用数连续十多年名列全国科研机构前列，高水平论文的数量稳步增加，国际论文被引用篇数次数的增加，显示了化学所基础理论研究的雄厚实力。1998年至2004年，化学所SCI收录论文为149、313、347、 440、474、575、508篇，列全国科研机构第3、2、2、2、1、1、1名。化学研究所以深厚的学科积累、优秀的人才队伍和研究实力为基础，已经发展成为我国化学领域内有很强综合能力和创新能力、在国际上有一定影响的重要研究机构。